Михайловский районный суд был создан 14 ноября 1960 года. До этого, с 1935 года, существовал участок народного суда Михайловского района.

С 1965 по 1975 годы народным судьей работала Лидия Петровна Просяная. Затем её сменила Елена Ивановна Сердюк, руководившая коллективом до 1979 года.

В 1979 году Михайловский районный суд стал двухсоставным и народным судьей и председателем суда был избран Валерий Павлович Зимоздрин. За 6 лет работы Валерий Павлович сделал очень многое для развития коллектива. Благодаря его усилиям, суд переехал в современное просторное здание, в котором находится и сегодня.

С 1985 по 1987 годы суд возглавлял Александр Михайлович Редькин.

Существенные изменения в суде произошли в период работы председателем Бориса Дмитриевича Кочергина, который возглавлял Михайловский суд с 1987  по 1998 годы. В этот период штат суда значительно расширился, и отправлять правосудие на территории района стали четыре судьи.

         После ухода Кочергина Б.Д. в почетную отставку с 1998 года по июль 2014 года коллектив Михайловского районного суда возглавлял Александр Иванович Юденков, работавший судьей с 1990 года и находящийся в настоящее время в почетной отставке.

          С 2003 года суд стал пятисоставным.

В декабре 2014 года председателем Михайловского районного суда назначен Дондик Александр Николаевич, проработавший до ноября 2018 года. В настоящее время Александр Николаевич возглавляет Уссурийский районный суд. 

С апреля 2019 года председателем Михайловского районного суда назначена Родик Светлана Геннадьевна, в должности председателя суда проработавшая до апреля 2025 года.

         На сегодняшний день в Михайловском районном суде совместно с председателем суда – Казаковой Дарьей Александровной, назначенной на должность с августа 2025 года, судебную власть представляют федеральные судьи: Родик Светлана Геннадьевна, Иванова Мария Юрьевна, Юрышев Сергей Сергеевич.